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多年以前，人類以超級戰艦「轟天號」在南極擊敗了數度毀滅城市的怪獸王「哥吉拉」，並且將哥吉拉封印在南極的冰層下。但是地球除了哥吉拉以外，其實還有許許多多的怪獸正對著世界各大都市虎視眈眈。於是人類成立了專門對付各種怪獸的「地球防衛軍」。而地球防衛軍最強大的成員，就是當年封印哥吉拉的「轟天號」以及其艦長「道格拉斯·戈登上校」。 此外，為了應付怪獸對人類造成的困擾，地球防衛軍特別甄選出了有特殊能力的人類，由於這些人類擁有普通人類所沒有的「M染色體」，使得他們擁有比普通人更強大的體能跟敏捷性能夠應付怪獸...

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空手道達人向來都是男性，誰能料到傳說中到處撂倒黑帶高手的，竟是一個穿水手服的高中女生！心高氣傲的空手道好手土屋圭，為得到教練認同，四處挑戰黑帶高手，卻意外陷入與其教練有多年宿怨的「毀滅團」圈套，令自己和教練都身陷危險，並在這次危機中，逐漸體會空手道的真義。...

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